Expresión diferencial de microARNs en Embolia Pulmonar vinculada a Apnea Obstructiva del Sueño
AUTORES
C. Carrera Cueva, M. Gratacós Aurich, N. Sola Idigora, M.D. Nuñez Ollero, I. Cano Pumarega, V. Cabriada Nuño, A. Rivas Guerrero, D. Hervás Marín, C. Caballero Eraso, R. Otero Candelera
INTRODUCCIÓN
Estudios recientes sugieren que los microARNs (miRNAs) podrían desempeñar un papel clave en la interacción fisiopatológica entre la apnea obstructiva del sueño (AOS) y la embolia pulmonar (EP). Resultados previos de nuestro grupo sugieren que la presencia de AOS podría influir en la persistencia de defectos de perfusión tras una EP. El objetivo de este trabajo fue determinar los miRNAs diferenciados entre los pacientes diagnósticados de AOS y que sufrieron una EP.
METODOLOGÍA
Se analizaron muestras sanguíneas extraídas de pacientes incluídos en el estudio NIX (estudio de prevalencia y efecto de la AOS en la persistencia de defectos de perfusión tras una EP aguda). Se aisló el ARN total del plasma y se cuantificó la expresión de 179 miRNAs en 24 pacientes con EP, divididos en dos grupos en función de la presencia o no de AOS y macheados por edad y sexo. Para el análisis de expresión de miRNAs se utilizó R versión 4.3.2. Para el Modelo Lineal Generalizado Elastic-Net, los miRNAs identificados junto con sus coeficientes se extrajeron del modelo más ajustado. Para la identificación de genes diana y rutas, se emplearon las bases de datos KEGG (Release 112.0) y mirWalk (versión 3). Cytoscape (versión 3.10.1) fue utilizado para la visualización y análisis del interactoma.
RESULTADOS
Un panel de 16 miRNAs sirvieron para construir el modelo de expresión diferencial entre un paciente con y sin AOS (Figura 1). De estos, 9 presentaron una mayor influencia en el modelo con un coeficiente de estimación > 0,4 (mir_32_5p, mir_328_3p, mir_128_3p, mir_132_3p, mir_136_5p, mir_1260a, mir_99b_5p, mir 335_5p, mir_136_3) (Figura 1). En el análisis de interacción de vías y genes comunes, se obtuvieron los genes diana y vías de señalización que están más afectados por varios microARNs (Figura 2).
CONCLUSIONES
En pacientes que sufrieron una EP, hemos identificado un panel de 16 miRNas diferenciados en función del diagnóstico de AOS, potenciales biomarcadores de esta entidad. Además, hemos generado un marco de genes y vías metabólicas comunes en las que estos miRNAs están implicados. Sin embargo, se requieren estudios adicionales para validar estos resultados y explorar su relevancia .
